学业期满成绩合格颁发厦门医学院全日制普通高等学校相应学历毕业证书，其中本科毕业生符合学位授予条件的，可授予相应的学士学位。

学校设有国家奖学金、国家励志奖学金、学校奖学金、国家助学金、生源地助学贷款、勤工助学、学校特殊困难补助金。