武汉交通职业学院因长江水运而生，随中国交通事业而兴。学校创办于1953年，由原交通运输部所属的武汉交通管理干部学院和武汉水运工业学校合并组建而成，2000年从交通部长航局划归湖北省教育厅管理。湖北省教育厅、交通运输部长江航务管理局2010年、2024年两轮“厅局共建”，为学校保留行业办学优势，共同指导学校高质量发展。