根据国家有关规定，学生入学须缴纳学费、住宿费等费用。根据属地管理原则，学校按照辽宁省物价局和辽宁省教育厅批准的收费标准收费。

学校2013年收费标准暂定为：航海技术、轮机工程（海上方向）、船舶电子电气工程收取杂费2500元／生·学年；电子信息工程、计算机科学与技术、英语、日语、通信工程、电气工程及其自动化、软件工程、土木工程、网络工程、智能科学与技术、物联网工程等专业收取学费5200元／生·学年；法学、物流工程、交通运输等专业收取学费4800元／生·学年；物流管理、交通管理（原航运管理）等专业收取学费4700元／生·学年；其它所有本科专业收取学费4600元／生·学年。学生的住宿费根据住宿条件的不同，分为500元/生·学年、1000元/生·学年和1200元/生·学年三种标准。入学后，学校根据专业、学生性别统一安排住宿。具体标准根据辽宁省物价局批复以后的收费标准执行。学生因故退学或提前结束学业，学校根据学生实际学习时间，按月计退剩余学费。根据国家有关文件，就业不上船工作的航海类专业毕业生应向学校偿还专业奖学金并补足与非航海类专业学费差额。