截至2016年9月，学校设有临床医学院、 基础医学院、口腔医学院、公共卫生与管理学院、中医学院（回医学院）、护理学院(高等卫生职业技术学院)、药学院、理学院、继续教育学院、国际教育学院、马克思主义学院（人文社会科学部）、体育部、外国语教学部等13个教学机构，12个教辅科研机构。建成了较为完善的大学医院系统，有13所附属医院（直属附属医院2所，直属附属专科医院3所），16所教学医院，90余所实习医院和实践教学基地。