学院现设有植物科学技术系、风景园林技术系、动物科学技术系、农业生物与生态技术系、农业经济管理系、农业信息工程系、基础部和思想政治理论研究部等六系二部，开设22个专业，形成以园艺技术、园林技术、动物医学、生物技术及应用、农业经济管理和软件技术（农业信息技术）等6大农业特色专业群，学院涉农专业体系健全，涵盖了农林牧副渔等农学专业大类，基本对接了上海现代都市农业需求。