学校设有临床医学、医学技术、中医、护理、药学、基础医学、公共基础、思政教学8个教学系部。学校实践教学体系完善，校内建有基础医学、护理、临床、中医、药学五个职业教育实训中心和中药科技馆、生命科学馆、三峡中医药文化陈列馆，有直属附属医院1所，非直属附属医院7所。