同济大学按照教育部有关规定及上海市物价局核定标准收取学费和住宿费，采用按学分收取学费的收费政策：普通本科专业每年预收5000元，其中建筑学、临床医学、口腔医学专业二年级起每年预收6000元;软件工程专业二年级预收6500元，三、四年级每年预收16000元。艺术类专业每年预收10000元;机械类(中外合作办学)专业每年预收15000元。住宿费根据住宿条件标准不同，一般为每学年600-1200元。

同济大学为家庭经济困难新生开设“绿色通道”，通过“奖、助、贷、补、勤、免、偿”七大资助体系和“保障型资助、发展型资助、成长型资助”多维资助育人模式，保障学生安心在校学习生活，促进包括家庭经济困难学生在内的全体学生全面成长成才。