所属部门不同：

公安类院校：是指由公安部和省级公安机关直属和管理的为公安机关培养人民警察的高等院校，按隶属关系分部属和省属两类，所属部门是公安部和省级公安机关。

司法类院校：是指由司法部和省级司法行政机关直属和管理的为监狱，劳动教养机关培养人民警察的高等院校，所属部门是司法部。

涉及的专业范围不同：

公安类院校：主要学习的专业有治安学、侦查学、情报学、犯罪学、经济犯罪侦查、公安管理学、警务指挥与战术、交通管理工程、公安视听技术、刑事科学技术等。司法类院校：法学、监狱学、教育学、行政管理、汉语言文学、信息管理与信息系统掩分等。

警种不同：公安类院校：主要有治安警察、户籍警察、刑事犯罪侦查警察、交通警察、巡逻警察、外事警察、经济犯罪侦查警察、网络安全监察警察、禁毒警察、警务督察等。
司法类院校：主要有检察院警察、法院警察、监狱、劳教系统警察等。