公办院校、民办院校、独立学院都是经相关部门批准的具有独立颁发资格的学校。

1、公办院校，独立学院和民办院校的办学主体不同：公办院校是由国家或地方政府组建的大学，由国家或地方政府提供建设资金，既有本科院校也有专科院校;独立学院的举办方是实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合作，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校，因此独立学院一般是设在某个本科大学的名下，因此独立学院均为本科院校。民办院校则资金来源完全靠自筹，是“社会力量举办的教育机构”,有自己的校名、组织机构、师资、校园，自己独立颁发毕业证书，民办院校与公办院校一样既有本科院校也有专科院校。

2、公办院校、独立学院和民办院校的毕业生都可以获得获国家承认的学历证书，证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。但独立学院毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而非某某大学校名印章。

3、公办院校和独立学院、民办院校的学费不同：公办本科院校学费一般比较低廉，在4000-8000元/年之间，民办本科院校和独立学院学费一般在都过万元。