电子工程系开设有电子信息工程技术、应用电子技术（楼宇智能化方向）、通信技术、光电子技术等四个专业，其中电子信息工程技术专业、通信技术专业、应用电子技术专业（楼宇智能化方向）为省级精品专业，电子信息工程技术专业为国家级重点建设专业，有1门国家级精品课程、4门省级精品课程、2个“省级专业教学团队”、2位省级教学名师、获得多项教学成果和荣誉。全系有多位教师在全国及省级学术组织担任重要职务，主持和参与多项国家级、省级、校级教科研课题。

电子工程系建有设备先进、功能完备的国家级实训基地。结合专业特点与企业共建嵌入式技术应用系统中心、芯片级检测与维修中心、现代通信工程技术中心、楼宇智能化工程技术中心、光电器件集成加工中心、太阳能光伏发电工程技术中心等实训平台，与复旦大学电光源研究所联合成立了“电光源测试分析中心”。实训基地设备总值1500多万元，可承担智能楼宇管理师、电子元器件检验员、无线电装接工、通信终端产品维修工、印刷电路板制作工等多个工种的中、高级工和技师、高级技师的职业技能培训和鉴定考评工作。

近年来，电子工程系学生在各类国家级、省级职业技能竞赛中屡创佳绩。如：2009年—2011年连续三年电子工程系学生代表队在福建省职业技能大赛（高职组）比赛中荣获电子技术类项目多项第一名，并代表福建省参加全国职业技能大赛（高职组），共获得一项一等奖、五项二等奖、三项三等奖，填补了福建省在此项大赛中一等奖的空白，得到了省教育厅的通报嘉奖。