南科大是公办大学，拥有国际化大学的办学条件，但是学费和住宿费却坚持国内一般公办大学的标准，在校本科生学费为每人每学年6000元人民币，住宿费为每人每学年1200元人民币。同学从录取入学到毕业4年期间，都有机会争取获得各级各类奖学金，覆盖面居于国内知名大学前列。